念了几年的研究生，电脑里收集了近7千篇pdf全文，建立了一些文献的获取和处理的经验，总结出来。希望能得到批评，以进一步提高管理效率。先用一张流程图来概括文献的获取和管理流程。
几点补充说明：
- 文献的获取包括：（1）使用MyNCBI关键词订阅：包括特定作者（在我的研究领域我所感兴趣的作者）、单位（我们研究所）和主题词（发表在高分杂志上的肝癌论文）等等。（2）特定杂志的订阅：一般使用该杂志官方网站提供的服务，包括Nature系列的几个杂志，Hepatology、Lancet Oncology、Journal of Clincical Oncology等。
- 这些更新都使用邮件订阅到Gmail里，如果收到更新时恰好有时间，就当场根据题录（主要是标题和摘要）筛选感兴趣的论文，获取全文，使用我的方法规范化文件名，保存到桌面上。大部分时候是没有时间，只是扫一遍之后，打上星标。因为Gmail有Priority Inbox的功能，这些打上了星标的邮件就在邮箱首页形成了一个很好的Starred列表，相当于To-Do list。有时间的时候，看完一封邮件，去除星标，算是完成一个任务。
- 文献的全文获取后，我习惯使用自己的命名规则来规范化文件名，以方便使用Everything软件根据文件名进行全盘检索。我的规则是“[杂志名，年份]论文标题的缩写”。其实对于pdf文档，最好的办法是编辑文件的标签，但是检索起来相对困难、大多数杂志也不管pdf标签（Cell Press旗下的期刊都非常规范，这里要赞一下），其实最主要的原因是当我意识到规范化标签的时候，我已经收集了有3千多个pdf文档了，回溯的工作量过于巨大，只好放弃。如果你刚开始收集文献，那还是建议使用规范化的pdf标签来管理文档。
- 整理到桌面的文献全文，需要在有兴致的时候再浏览详细浏览全文。大部分文献只是扫几眼，标注几点感兴趣的东西，然后就移动到我的文档里相应的目录归类存档；有些重要的文章我会记录读书笔记，记录到Word文档里，方便以后复习。有些觉得有分享必要的，例如肝癌的临床研究进展和一些有兴趣的大众医学的东西，会写篇日志在blog分享。
- 阅读过程中经常会碰到有兴趣的参考文献，也会找到全文后放到桌面上当场或以后再翻看。有的几年前发表的一个观点的文章，我会看看这篇文章的被引用情况，了解这个观点的进展。这就是所谓的越查越深和越查越新。
